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  • 本发明涉及环境抗生素抗性基因(ARG)风险评估领域,针对现有研究中微塑料对ARG丰度结论不一致,以及仅依赖相对丰度(以16S rRNA基因等作为基准进行归一化的丰度)或绝对丰度(基于拷贝数的丰度)易导致评价片面的问题,提供一种引入Meta分...
  • 本发明涉及一种结合玉米籽粒高光谱数据的全基因组预测方法,属于植物育种技术领域。该方法首先获取亲本基因组、高光谱数据及杂交种表型数据;对高光谱数据进行多种预处理,筛选出最佳预处理方法;基于亲本数据推测杂交种的基因组与高光谱矩阵;分别构建基因组...
  • 本发明属于数据处理领域,具体涉及一种基于多组学融合的生猪遗传评估系统。该系统包括异构数据湖仓一体平台、动态环境感知编码装置、生物学知识图谱存储服务器、因果图神经网络处理中心、中心服务集群及分布于各养殖场的边缘计算终端。平台整合多源异构组学数...
  • 本发明公开了一种基于知识图谱嵌入的水稻耐旱基因预测方法及系统,方法包括以下步骤:构建水稻知识图谱的本体层;从不同数据库中采集水稻基因的多源数据并进行知识抽取,根据本体层的规范对抽取的知识进行融合得到不同的知识三元组并导入图数据库,从而构建水...
  • 本发明公开了一种用于林木育种的SNP液相芯片构建方法及应用,属于林木分子育种技术领域。本发明包括:基于目标物种多个种质资源的全基因组重测序数据,经过第一套筛选参数初筛,获得高质量的候选背景位点池,并对其进行探针设计可行性及基因组空间分布优化...
  • 本发明提供了一种基于全基因组选择的菊花抗蚜性预测体系构建方法及应用。本发明通过全基因组关联分析鉴定与菊花抗蚜性显著相关的SNP位点,通过比较不同统计模型和不同密度SNP标记对全基因组预测精度的影响,建立了一种基于GWAS辅助全基因组选择快速...
  • 本发明公开一种精确评估长牡蛎种质纯度的方法,涉及水产遗传育种生物技术领域,其核心是借助全基因组重测序技术,基于NCBI长牡蛎基因组序列构建索引,采集自然群体长牡蛎与福建牡蛎各150只,提取外套膜DNA测序,筛选出635个特异SNP位点,构建...
  • 本发明提供基于可穿戴设备信号与基因标志物的心脏猝死预警方法,包括:利用自然语言处理和生物信息学算法提取用户历史病历与全基因组SNP位点,筛选获得关键基因标志物;采用可穿戴设备多维生理信号并聚类划分状态区间,结合基因和生理参数,通过跨模态互信...
  • 本发明公开了DNA多维度亲缘智配寻踪系统、方法、存储介质及电子设备,该系统包括:案件管理模块,用于创建案件档案;多模态数据导入模块,用于提供DNA‑STR数据的录入接口;目标人群库构建模块,用于创建目标人群库,并将目标人群的DNA‑STR数...
  • 本发明公开基于全基因组关联分析的标记预选与基因组选择相结合的湿地松材性相关性状的预测方法和系统,方法包括:步骤(1)、采集湿地松样本目标性状的表型数据集合和基因型数据集合作为样本集合;步骤(2)、构建并确定基础模型;步骤(3)、对目标性状执...
  • 本发明提供一种抗新冠病毒药物筛选全体系的建立方法,通过靶向病毒入侵(假病毒模型)、RdRp活性(复制转录)、Mpro/3CLpro活性(多聚蛋白切割)等多个关键环节,实现对病毒全生命周期的系统性把控,解决了单一靶点模型的局限性。通过构建多种...
  • 本发明涉及一种微生物靶向测序阳性阈值的预测模型及其构建方法和应用。所述方法包括以下步骤:(S1)收集已知微生物样本的信息及其tNGS检测结果,作为数据集;(S2)筛选tNGS检测结果中的特征量,作为特征量集;(S3)将所述数据集划分为训练集...
  • 本发明公开了一种结合共甲基化模块与细胞成分关联分析的癌症标志物筛选方法及系统,涉及生物信息学技术领域,方法包括:获取癌症组织样本组与对照组织样本组的DNA甲基化测序数据并预处理生成甲基化矩阵;差异甲基化分析得到差异位点并按邻近合并规则形成差...
  • 本发明提供了一种利用图神经网络推断鸡基因‑病原互作网络的方法及系统,涉及数据处理技术领域,包括首先获取同一时间尺度下鸡个体的多组学原始数据;通过跨物种统一图结构构建处理,将基因与病原体序列映射到统一拓扑空间并基于时序共现构建初始互作图;结合...
  • 本发明提供一种基于机器学习与多策略进化算法的氨基酸序列从头设计方法及系统,适用于基因治疗、抗体或蛋白质药物开发领域,尤其用于多功能病毒衣壳蛋白的智能化设计。该方法以腺相关病毒(AAV)衣壳蛋白为优选实施对象,通过预训练语言模型、序列生成模型...
  • 本申请的目的是提供一种用于确定在目标宿主中表达的目标酶的方法、设备、介质及程序产品,该方法包括:基于满足所需功能的异源酶对应的氨基酸序列信息、结构信息与目标宿主的信息,利用密码子序列预测模型,从中筛选确定一个或多个目标酶,其中,所述密码子序...
  • 本申请涉及一种基线建模的方法、MSI状态检测的方法及存储介质,本申请通过选取基线样本以及目标MSI位点,对基线样本进行二代测序,得到测序序列;根据唯一分子标签对所述测序序列进行分组,对每组内的测序序列进行碱基矫正,筛选出各组位点的最优序列;...
  • 本申请公开了一种基于聚类与图构建对三代测序数据进行组装的方法、系统、设备和介质,属于生物序列处理技术领域。本申请的方法包括以下步骤:基于所述三代测序数据获得序列相似度,利用聚类算法将序列进行聚类,得到不同的簇;对同一簇内的序列基于图构建的方...
  • 本申请提供基于转录组多重比对数据的融合转录本识别方法、装置、系统及介质,其核心在于构建了一套面向多重映射读段的全链条分析框架,来实现融合基因检测。包括:基于宽松映射策略的配对读段初筛模块、基于外显子图结构的候选融合构建模块、基于增强参考转录...
  • 本发明公开了一种基于深度学习的胶原蛋白熔解温度预测方法,包括:根据动态掩码处理后的胶原蛋白序列,结合氨基酸种类进行多维编码,根据动态掩码进行序列处理,得到多维特征张量;根据多维特征张量,依次通过两层卷积层进行特征映射;进而根据动态掩码,对卷...
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